Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RoraP51448 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RoraP51448 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RoraP51448 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RoraP51448 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RoraP51448 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RoraP51448 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RoraP51448 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RoraP51448 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RoraP51448 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RoraP51448 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RoraP51448 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RoraP51448 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RoraP51448 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RoraP51448 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RoraP51448 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RoraP51448 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RoraP51448 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RoraP51448 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RoraP51448 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RoraP51448 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RoraP51448 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RoraP51448 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RoraP51448 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RoraP51448 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RoraP51448 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RoraP51448 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RoraP51448 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RoraP51448 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RoraP51448 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RoraP51448 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RoraP51448 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RoraP51448 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RoraP51448 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RoraP51448 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RoraP51448 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RoraP51448 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RoraP51448 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RoraP51448 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RoraP51448 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RoraP51448 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RoraP51448 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RoraP51448 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RoraP51448 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RoraP51448 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RoraP51448 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RoraP51448 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RoraP51448 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RoraP51448 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RoraP51448 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RoraP51448 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RoraP51448 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RoraP51448 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RoraP51448 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RoraP51448 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RoraP51448 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RoraP51448 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RoraP51448 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RoraP51448 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RoraP51448 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RoraP51448 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RoraP51448 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RoraP51448 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RoraP51448 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RoraP51448 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RoraP51448 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RoraP51448 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RoraP51448 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RoraP51448 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RoraP51448 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RoraP51448 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RoraP51448 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RoraP51448 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RoraP51448 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RoraP51448 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RoraP51448 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RoraP51448 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RoraP51448 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RoraP51448 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RoraP51448 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RoraP51448 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RoraP51448 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RoraP51448 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RoraP51448 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RoraP51448 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RoraP51448 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RoraP51448 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RoraP51448 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RoraP51448 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RoraP51448 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RoraP51448 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RoraP51448 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RoraP51448 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RoraP51448 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RoraP51448 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RoraP51448 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RoraP51448 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RoraP51448 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RoraP51448 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RoraP51448 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms