Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Defa-rs12P50716 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Defa-rs12P50716 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Defa-rs12P50716 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Defa-rs12P50716 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Defa-rs12P50716 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Defa-rs12P50716 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Defa-rs12P50716 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defa-rs12P50716 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Defa-rs12P50716 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defa-rs12P50716 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defa-rs12P50716 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defa-rs12P50716 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defa-rs12P50716 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Defa-rs12P50716 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defa-rs12P50716 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defa-rs12P50716 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defa-rs12P50716 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defa-rs12P50716 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Defa-rs12P50716 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Defa-rs12P50716 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Defa-rs12P50716 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Defa-rs12P50716 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Defa-rs12P50716 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Defa-rs12P50716 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Defa-rs12P50716 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Defa-rs12P50716 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms