Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SftpdP50404 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SftpdP50404 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SftpdP50404 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SftpdP50404 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SftpdP50404 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SftpdP50404 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SftpdP50404 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SftpdP50404 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SftpdP50404 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SftpdP50404 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SftpdP50404 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SftpdP50404 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms