Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LtbrP50284 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LtbrP50284 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LtbrP50284 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LtbrP50284 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LtbrP50284 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LtbrP50284 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LtbrP50284 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LtbrP50284 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LtbrP50284 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LtbrP50284 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LtbrP50284 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LtbrP50284 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LtbrP50284 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms