Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcl5P50228 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl5P50228 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms