Protein–RNA interactions for Protein: P49312

Hnrnpa1, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnrnpa1P49312 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hnrnpa1P49312 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hnrnpa1P49312 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hnrnpa1P49312 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hnrnpa1P49312 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hnrnpa1P49312 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms