Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prox1P48437 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prox1P48437 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prox1P48437 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prox1P48437 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prox1P48437 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prox1P48437 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prox1P48437 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prox1P48437 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prox1P48437 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prox1P48437 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prox1P48437 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Prox1P48437 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prox1P48437 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prox1P48437 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms