Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl5P47962 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl5P47962 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms