Protein–RNA interactions for Protein: P47941

Crkl, Crk-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrklP47941 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CrklP47941 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CrklP47941 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CrklP47941 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CrklP47941 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CrklP47941 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CrklP47941 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CrklP47941 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CrklP47941 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CrklP47941 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CrklP47941 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CrklP47941 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CrklP47941 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CrklP47941 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CrklP47941 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CrklP47941 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CrklP47941 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CrklP47941 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CrklP47941 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CrklP47941 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CrklP47941 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CrklP47941 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CrklP47941 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CrklP47941 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CrklP47941 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CrklP47941 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CrklP47941 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CrklP47941 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CrklP47941 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CrklP47941 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CrklP47941 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CrklP47941 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CrklP47941 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CrklP47941 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CrklP47941 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CrklP47941 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CrklP47941 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CrklP47941 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CrklP47941 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CrklP47941 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CrklP47941 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CrklP47941 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CrklP47941 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CrklP47941 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CrklP47941 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CrklP47941 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CrklP47941 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CrklP47941 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CrklP47941 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CrklP47941 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CrklP47941 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CrklP47941 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CrklP47941 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CrklP47941 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CrklP47941 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CrklP47941 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CrklP47941 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CrklP47941 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CrklP47941 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CrklP47941 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CrklP47941 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CrklP47941 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CrklP47941 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CrklP47941 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CrklP47941 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CrklP47941 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CrklP47941 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CrklP47941 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CrklP47941 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CrklP47941 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CrklP47941 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CrklP47941 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CrklP47941 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CrklP47941 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CrklP47941 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CrklP47941 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CrklP47941 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CrklP47941 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CrklP47941 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CrklP47941 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CrklP47941 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CrklP47941 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CrklP47941 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CrklP47941 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CrklP47941 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CrklP47941 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CrklP47941 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CrklP47941 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CrklP47941 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CrklP47941 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CrklP47941 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CrklP47941 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CrklP47941 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CrklP47941 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CrklP47941 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CrklP47941 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CrklP47941 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CrklP47941 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CrklP47941 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CrklP47941 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms