Protein–RNA interactions for Protein: P46460

Nsf, Vesicle-fusing ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsfP46460 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NsfP46460 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NsfP46460 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NsfP46460 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NsfP46460 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NsfP46460 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NsfP46460 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NsfP46460 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NsfP46460 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NsfP46460 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NsfP46460 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NsfP46460 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NsfP46460 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NsfP46460 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NsfP46460 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NsfP46460 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NsfP46460 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NsfP46460 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NsfP46460 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NsfP46460 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NsfP46460 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NsfP46460 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NsfP46460 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NsfP46460 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NsfP46460 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NsfP46460 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NsfP46460 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NsfP46460 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NsfP46460 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NsfP46460 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NsfP46460 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NsfP46460 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NsfP46460 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NsfP46460 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NsfP46460 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NsfP46460 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NsfP46460 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NsfP46460 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NsfP46460 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NsfP46460 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NsfP46460 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NsfP46460 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NsfP46460 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NsfP46460 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NsfP46460 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NsfP46460 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NsfP46460 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NsfP46460 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NsfP46460 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NsfP46460 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NsfP46460 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NsfP46460 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NsfP46460 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NsfP46460 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NsfP46460 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NsfP46460 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NsfP46460 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NsfP46460 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NsfP46460 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NsfP46460 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NsfP46460 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NsfP46460 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NsfP46460 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NsfP46460 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NsfP46460 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NsfP46460 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NsfP46460 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NsfP46460 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NsfP46460 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NsfP46460 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NsfP46460 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NsfP46460 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NsfP46460 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NsfP46460 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NsfP46460 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NsfP46460 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NsfP46460 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NsfP46460 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NsfP46460 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NsfP46460 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NsfP46460 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NsfP46460 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NsfP46460 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NsfP46460 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NsfP46460 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NsfP46460 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NsfP46460 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NsfP46460 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NsfP46460 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NsfP46460 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NsfP46460 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NsfP46460 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NsfP46460 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NsfP46460 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NsfP46460 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NsfP46460 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NsfP46460 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NsfP46460 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NsfP46460 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NsfP46460 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms