Protein–RNA interactions for Protein: P43024

Cox6a1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6a1P43024 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cox6a1P43024 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox6a1P43024 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox6a1P43024 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox6a1P43024 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox6a1P43024 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox6a1P43024 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox6a1P43024 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox6a1P43024 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox6a1P43024 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox6a1P43024 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox6a1P43024 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox6a1P43024 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox6a1P43024 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox6a1P43024 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms