Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ighmbp2P40694 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ighmbp2P40694 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms