Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lig1P37913 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lig1P37913 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lig1P37913 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lig1P37913 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lig1P37913 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lig1P37913 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lig1P37913 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lig1P37913 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lig1P37913 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lig1P37913 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms