Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sar1aP36536 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sar1aP36536 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sar1aP36536 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sar1aP36536 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sar1aP36536 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sar1aP36536 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sar1aP36536 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sar1aP36536 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sar1aP36536 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sar1aP36536 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sar1aP36536 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sar1aP36536 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sar1aP36536 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sar1aP36536 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sar1aP36536 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sar1aP36536 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sar1aP36536 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sar1aP36536 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sar1aP36536 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sar1aP36536 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sar1aP36536 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sar1aP36536 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sar1aP36536 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sar1aP36536 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sar1aP36536 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sar1aP36536 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sar1aP36536 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sar1aP36536 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sar1aP36536 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sar1aP36536 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sar1aP36536 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sar1aP36536 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sar1aP36536 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sar1aP36536 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sar1aP36536 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sar1aP36536 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sar1aP36536 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sar1aP36536 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sar1aP36536 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sar1aP36536 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sar1aP36536 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sar1aP36536 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sar1aP36536 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sar1aP36536 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sar1aP36536 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sar1aP36536 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms