Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc1P34928 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms