Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptk2P34152 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptk2P34152 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms