Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Pola1P33609 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pola1P33609 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pola1P33609 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pola1P33609 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pola1P33609 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Pola1P33609 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Pola1P33609 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pola1P33609 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pola1P33609 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pola1P33609 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pola1P33609 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pola1P33609 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pola1P33609 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pola1P33609 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pola1P33609 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pola1P33609 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pola1P33609 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pola1P33609 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pola1P33609 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pola1P33609 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pola1P33609 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pola1P33609 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pola1P33609 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pola1P33609 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pola1P33609 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pola1P33609 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pola1P33609 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pola1P33609 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pola1P33609 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pola1P33609 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pola1P33609 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pola1P33609 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pola1P33609 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms