Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nedd1P33215 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nedd1P33215 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms