Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vcam1P29533 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vcam1P29533 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vcam1P29533 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vcam1P29533 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vcam1P29533 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vcam1P29533 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vcam1P29533 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vcam1P29533 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vcam1P29533 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vcam1P29533 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vcam1P29533 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vcam1P29533 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vcam1P29533 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vcam1P29533 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vcam1P29533 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Vcam1P29533 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Vcam1P29533 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vcam1P29533 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vcam1P29533 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vcam1P29533 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vcam1P29533 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vcam1P29533 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vcam1P29533 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vcam1P29533 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vcam1P29533 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vcam1P29533 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vcam1P29533 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.3 ms