Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd9P28357 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms