Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa3P28310 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa3P28310 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa3P28310 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa3P28310 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa3P28310 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa3P28310 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa3P28310 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa3P28310 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa3P28310 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa3P28310 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa3P28310 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms