Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb1P28230 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjb1P28230 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms