Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjc1P28229 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjc1P28229 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms