Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc5P27641 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc5P27641 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Xrcc5P27641 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc5P27641 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc5P27641 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc5P27641 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc5P27641 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc5P27641 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc5P27641 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc5P27641 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc5P27641 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc5P27641 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc5P27641 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc5P27641 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc5P27641 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc5P27641 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xrcc5P27641 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xrcc5P27641 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xrcc5P27641 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.9 ms