Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfraP26618 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PdgfraP26618 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms