Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aldh1a1P24549 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms