Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Hoxd11P23813 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Hoxd11P23813 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Hoxd11P23813 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC25,61■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25,61■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC25,6■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25,6■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC25,58■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Hoxd11P23813 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC25,55■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25,53■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Hoxd11P23813 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC25,5■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25,45■■□□□ 1,67
Hoxd11P23813 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36,5 ms