Protein–RNA interactions for Protein: P22893

Zfp36, mRNA decay activator protein ZFP36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36P22893 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp36P22893 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp36P22893 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp36P22893 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp36P22893 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp36P22893 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp36P22893 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp36P22893 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp36P22893 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp36P22893 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp36P22893 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zfp36P22893 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zfp36P22893 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zfp36P22893 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zfp36P22893 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp36P22893 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zfp36P22893 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms