Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn1P22387 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn1P22387 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn1P22387 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn1P22387 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn1P22387 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn1P22387 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn1P22387 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn1P22387 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn1P22387 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edn1P22387 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edn1P22387 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn1P22387 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Edn1P22387 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edn1P22387 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edn1P22387 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms