Protein–RNA interactions for Protein: P22366

Myd88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myd88P22366 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Myd88P22366 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Myd88P22366 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Myd88P22366 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Myd88P22366 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Myd88P22366 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Myd88P22366 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Myd88P22366 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Myd88P22366 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Myd88P22366 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Myd88P22366 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Myd88P22366 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Myd88P22366 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Myd88P22366 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Myd88P22366 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Myd88P22366 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Myd88P22366 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Myd88P22366 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Myd88P22366 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Myd88P22366 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Myd88P22366 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Myd88P22366 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Myd88P22366 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Myd88P22366 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Myd88P22366 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Myd88P22366 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Myd88P22366 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Myd88P22366 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Myd88P22366 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Myd88P22366 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Myd88P22366 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Myd88P22366 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Myd88P22366 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Myd88P22366 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Myd88P22366 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Myd88P22366 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Myd88P22366 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Myd88P22366 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Myd88P22366 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Myd88P22366 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Myd88P22366 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Myd88P22366 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Myd88P22366 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Myd88P22366 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Myd88P22366 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Myd88P22366 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms