Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ntf3P20181 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ntf3P20181 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms