Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ms4a1P19437 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ms4a1P19437 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ms4a1P19437 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms