Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NefhP19246 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NefhP19246 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NefhP19246 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NefhP19246 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefhP19246 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefhP19246 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefhP19246 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefhP19246 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefhP19246 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefhP19246 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefhP19246 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefhP19246 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefhP19246 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefhP19246 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefhP19246 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefhP19246 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefhP19246 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefhP19246 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NefhP19246 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NefhP19246 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NefhP19246 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NefhP19246 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NefhP19246 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NefhP19246 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NefhP19246 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NefhP19246 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NefhP19246 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NefhP19246 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NefhP19246 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NefhP19246 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NefhP19246 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NefhP19246 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NefhP19246 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NefhP19246 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NefhP19246 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NefhP19246 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NefhP19246 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NefhP19246 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NefhP19246 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NefhP19246 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NefhP19246 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NefhP19246 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NefhP19246 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NefhP19246 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NefhP19246 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NefhP19246 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NefhP19246 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NefhP19246 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NefhP19246 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NefhP19246 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NefhP19246 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NefhP19246 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NefhP19246 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NefhP19246 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NefhP19246 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NefhP19246 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NefhP19246 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NefhP19246 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NefhP19246 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NefhP19246 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NefhP19246 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NefhP19246 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NefhP19246 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NefhP19246 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NefhP19246 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NefhP19246 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NefhP19246 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NefhP19246 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NefhP19246 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NefhP19246 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NefhP19246 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NefhP19246 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NefhP19246 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NefhP19246 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NefhP19246 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NefhP19246 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NefhP19246 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NefhP19246 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NefhP19246 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NefhP19246 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NefhP19246 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NefhP19246 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NefhP19246 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NefhP19246 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NefhP19246 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NefhP19246 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NefhP19246 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NefhP19246 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NefhP19246 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NefhP19246 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NefhP19246 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NefhP19246 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NefhP19246 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NefhP19246 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NefhP19246 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NefhP19246 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NefhP19246 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NefhP19246 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NefhP19246 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191 ms