Protein–RNA interactions for Protein: P19001

Krt19, Keratin, type I cytoskeletal 19, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt19P19001 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt19P19001 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt19P19001 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt19P19001 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt19P19001 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt19P19001 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt19P19001 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt19P19001 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt19P19001 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt19P19001 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt19P19001 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt19P19001 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt19P19001 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt19P19001 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt19P19001 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt19P19001 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt19P19001 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt19P19001 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt19P19001 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt19P19001 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt19P19001 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt19P19001 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms