Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rps6ka1P18653 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps6ka1P18653 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps6ka1P18653 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms