Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P18530 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P18530 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18530 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18530 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18530 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18530 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18530 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18530 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18530 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18530 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18530 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18530 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18530 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18530 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
P18530 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18530 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18530 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18530 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18530 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18530 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18530 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18530 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18530 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18530 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18530 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P18530 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P18530 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P18530 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P18530 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P18530 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P18530 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P18530 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P18530 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P18530 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P18530 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P18530 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P18530 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P18530 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P18530 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P18530 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P18530 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P18530 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P18530 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P18530 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P18530 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P18530 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P18530 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
P18530 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
P18530 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P18530 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P18530 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
P18530 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P18530 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P18530 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P18530 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
P18530 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P18530 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P18530 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P18530 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P18530 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P18530 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P18530 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P18530 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P18530 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P18530 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P18530 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P18530 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P18530 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
P18530 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P18530 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P18530 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P18530 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P18530 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P18530 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P18530 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P18530 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P18530 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P18530 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P18530 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P18530 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P18530 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P18530 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P18530 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P18530 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P18530 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P18530 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P18530 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P18530 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P18530 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
P18530 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P18530 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P18530 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P18530 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
P18530 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P18530 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P18530 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P18530 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
P18530 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P18530 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms