Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra6P16305 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra6P16305 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms