Protein–RNA interactions for Protein: P16015

Ca3, Carbonic anhydrase 3, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca3P16015 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ca3P16015 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ca3P16015 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ca3P16015 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ca3P16015 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ca3P16015 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ca3P16015 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ca3P16015 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ca3P16015 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ca3P16015 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ca3P16015 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ca3P16015 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms