Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lmnb1P14733 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lmnb1P14733 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lmnb1P14733 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmnb1P14733 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmnb1P14733 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms