Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DmdP11531 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DmdP11531 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DmdP11531 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DmdP11531 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DmdP11531 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DmdP11531 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DmdP11531 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DmdP11531 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DmdP11531 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DmdP11531 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DmdP11531 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DmdP11531 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DmdP11531 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DmdP11531 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DmdP11531 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DmdP11531 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DmdP11531 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DmdP11531 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DmdP11531 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DmdP11531 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DmdP11531 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DmdP11531 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DmdP11531 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DmdP11531 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DmdP11531 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DmdP11531 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DmdP11531 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
DmdP11531 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DmdP11531 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DmdP11531 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DmdP11531 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DmdP11531 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DmdP11531 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DmdP11531 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DmdP11531 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DmdP11531 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DmdP11531 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DmdP11531 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DmdP11531 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DmdP11531 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DmdP11531 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DmdP11531 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DmdP11531 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DmdP11531 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DmdP11531 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DmdP11531 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DmdP11531 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DmdP11531 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DmdP11531 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DmdP11531 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DmdP11531 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DmdP11531 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DmdP11531 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DmdP11531 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DmdP11531 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DmdP11531 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DmdP11531 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DmdP11531 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DmdP11531 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DmdP11531 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DmdP11531 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DmdP11531 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DmdP11531 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DmdP11531 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DmdP11531 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DmdP11531 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DmdP11531 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DmdP11531 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DmdP11531 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DmdP11531 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DmdP11531 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DmdP11531 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DmdP11531 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DmdP11531 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DmdP11531 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DmdP11531 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DmdP11531 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DmdP11531 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DmdP11531 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DmdP11531 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DmdP11531 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DmdP11531 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DmdP11531 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DmdP11531 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DmdP11531 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DmdP11531 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DmdP11531 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DmdP11531 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DmdP11531 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DmdP11531 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DmdP11531 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DmdP11531 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DmdP11531 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DmdP11531 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DmdP11531 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DmdP11531 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DmdP11531 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DmdP11531 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DmdP11531 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms