Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamp1P11438 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamp1P11438 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamp1P11438 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamp1P11438 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamp1P11438 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamp1P11438 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamp1P11438 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamp1P11438 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamp1P11438 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamp1P11438 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamp1P11438 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamp1P11438 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamp1P11438 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamp1P11438 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamp1P11438 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamp1P11438 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamp1P11438 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lamp1P11438 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lamp1P11438 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms