Protein–RNA interactions for Protein: P11087

Col1a1, Collagen alpha-1(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a1P11087 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col1a1P11087 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col1a1P11087 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms