Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sub1P11031 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sub1P11031 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sub1P11031 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sub1P11031 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sub1P11031 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sub1P11031 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sub1P11031 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sub1P11031 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sub1P11031 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sub1P11031 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sub1P11031 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms