Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nid1P10493 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nid1P10493 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nid1P10493 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nid1P10493 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nid1P10493 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nid1P10493 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nid1P10493 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nid1P10493 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nid1P10493 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nid1P10493 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nid1P10493 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nid1P10493 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nid1P10493 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nid1P10493 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nid1P10493 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nid1P10493 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nid1P10493 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nid1P10493 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nid1P10493 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nid1P10493 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nid1P10493 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nid1P10493 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nid1P10493 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nid1P10493 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nid1P10493 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms