Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Myod1P10085 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myod1P10085 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Myod1P10085 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Myod1P10085 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myod1P10085 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Myod1P10085 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Myod1P10085 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Myod1P10085 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Myod1P10085 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Myod1P10085 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Myod1P10085 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms