Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CatspereP0DP43 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CatspereP0DP43 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.6 ms