Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnmt3cP0DOY1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms