Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3P09920 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3P09920 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3P09920 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3P09920 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3P09920 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3P09920 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf3P09920 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf3P09920 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf3P09920 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3P09920 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Csf3P09920 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Csf3P09920 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms