Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb1P09055 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb1P09055 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb1P09055 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb1P09055 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms