Protein–RNA interactions for Protein: P08152

Egr2, E3 SUMO-protein ligase EGR2, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr2P08152 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr2P08152 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr2P08152 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr2P08152 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr2P08152 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr2P08152 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr2P08152 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr2P08152 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr2P08152 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr2P08152 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr2P08152 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr2P08152 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr2P08152 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr2P08152 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr2P08152 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr2P08152 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr2P08152 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr2P08152 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr2P08152 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr2P08152 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr2P08152 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr2P08152 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr2P08152 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr2P08152 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr2P08152 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Egr2P08152 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Egr2P08152 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Egr2P08152 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Egr2P08152 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr2P08152 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr2P08152 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr2P08152 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr2P08152 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr2P08152 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr2P08152 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr2P08152 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr2P08152 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr2P08152 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr2P08152 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr2P08152 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr2P08152 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr2P08152 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr2P08152 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr2P08152 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr2P08152 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr2P08152 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr2P08152 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr2P08152 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr2P08152 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr2P08152 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr2P08152 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr2P08152 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr2P08152 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr2P08152 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr2P08152 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms